Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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