Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms