Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp846G3X996 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms