Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms