Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms