Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms