Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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