Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms