Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms