Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms