Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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