Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms