Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms