Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms