Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms