Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl3E0CZ16 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms