Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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