Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms