Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms