Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms