Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms