Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms