Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms