Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatsperbA2RTF1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms