Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PtprfA2A8L5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PtprfA2A8L5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PtprfA2A8L5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PtprfA2A8L5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PtprfA2A8L5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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PtprfA2A8L5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PtprfA2A8L5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PtprfA2A8L5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PtprfA2A8L5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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