Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms