Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms