Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU7

Ighv1-82, Immunoglobulin heavy variable 1-82 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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