Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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