Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms