Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms