Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms