Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms