Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms