Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Scnn1gQ9WU39 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Scnn1gQ9WU39 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Scnn1gQ9WU39 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Scnn1gQ9WU39 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Scnn1gQ9WU39 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Scnn1gQ9WU39 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Scnn1gQ9WU39 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Scnn1gQ9WU39 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Scnn1gQ9WU39 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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