Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms