Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpv2Q9WTR1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms