Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms