Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcm1Q9R0L6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms