Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr54Q9R0D8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms