Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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