Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms