Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxe3Q9QY14 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms