Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Kcnip3Q9QXT8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Kcnip3Q9QXT8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Kcnip3Q9QXT8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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