Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms