Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms