Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms