Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms