Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms