Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms